亚美体育官方网站入口(中国)科技有限公司-我国科学家成功制作我国豌豆基因组高质量精密物理图谱
近来，我国农业科学院作物科学研讨所特征农作物优异种质资源开掘与立异使用立异团队联合国内外多家合作单位，成功制作了我国豌豆基因组高质量精密物理图谱，构建了培养和野生豌豆泛基因组，解析了豌豆基因组进化特征、集体遗传结构，为提醒豌豆来源驯化，以及基因发掘、种质立异、育种改善供给了名贵资源及数据支撑。相关研讨效果以长文的方式在线宣布在《天然遗传学（Nature Genetics）》杂志上。豌豆是粮菜饲绿肥兼用的北方一年生和南边越年生冷季食用豆类作物，具有丰厚的营养价值和显着的生态优势，在世界范围内广泛培养。自孟德尔发现遗传规律以来，豌豆作为遗传研讨的形式植物，受到了学界和大众的广泛重视。但是，豌豆基因组非常大，拼装起来适当杂乱，豌豆高质量基因组精密物理图谱一向未能完结，严峻阻止了豌豆的理论和应用研讨。该研讨团队使用我国豌豆主栽种类“中豌6号”，根据多种先进测序技能，整合优化多种拼装战略，供给了显着改善的豌豆高质量精密物理图谱和注释。中豌6号基因组拼装巨细约为3.8 Gb，归纳多种基因组拼装评价办法，一起证明该基因组在杂乱重复区域和转座子连续性、准确性和完整性方面都有优异体现。研讨人员还提醒了118 个培养和野生豌豆种质的基因组变异款式，处理了长期以来关于豌豆属物种区分的争议，证明了埃塞俄比亚豌豆是与野生豌豆和培养豌豆不同的独立物种，为豌豆来源驯化供给了新的见地。研讨剖析判定出了 25 个与12个豌豆重要农艺性状相关的数量性状位点（QTLs），还发现了两个从前已知的操控粒型（圆粒/皱粒）和株高（高/矮）的孟德尔基因R 和Le，以及一个与荚型（硬荚/软荚）相关的候选基因。一起，研讨构建了包括 116 个培养和野生豌豆种质的泛基因组，聚类生成了112,776个泛基因簇，在豌豆属下不同物种之间显示出差异显着的存在/缺失变异（PAV）形式和功用富集，其间，野生豌豆和埃塞俄比亚豌豆中特有的泛基因显示出显着不同的功用富集，标明它们在未来作为豌豆育种资源的重要潜力。该效果的宣布恰逢孟德尔诞辰200周年，豌豆高质量参阅基因组和泛基因组的发布，拓宽了咱们对豌豆巨大基因组背面遗传学的了解，为豌豆种质资源和育种改善研讨供给了名贵的基因组资源。汹涌新闻了解到，我国农业科学院作科所杨涛副研讨员和刘荣助理研讨员、中科院微生物所骆迎峰副研讨员和胡松年研讨员以及山东省农科院农作物种质资源研讨所王栋助理研讨员为论文的一起榜首作者。我国农业科学院作物科学研讨所宗绪晓研讨员、我国科学院微生物所高胜寒特别研讨助理、山东省农业科学院农作物种质资源研讨所丁汉凤研讨员、世界半干旱热带作物研讨所和澳大利亚默多克大学Rajeev K Varshney教授为论文的一起通讯作者。该研讨得到了国家重点研制方案、国家天然科学基金、食用豆现代工业技能系统、作物种质资源维护和我国农业科学院立异工程等项目的支撑。